Среди его самых известных работ — серия Blueberry, созданная совместно с писателем Жаном-Мишелем Шарлье. Будучи Мёбиусом, он создал широкий спектр научно-фантастических и фэнтезийных комиксов в сюрреалистическом, почти абстрактном стиле. Эти работы включают «Арзах» и «Герметичный гараж Джерри Корнелиуса». Жан Жиро сотрудничал с авангардистским режиссером Алехандро Ходоровски для несостоявшейся киноадаптации «Дюны» и серии комиксов «Инкал». Также Мёбиус работал с Федерико Феллини, Стэном Ли и Хаяо Миядзаки.

Мёбиус внес свой вклад в раскадровки и концептуальные проекты многочисленных научно-фантастических фильмов, таких как «Чужой», «Трон», «Пятый элемент» и «Бездна».